الهدف من دراسة علم الأحياء الدقيقة الطبي في أنه يساعد في تحديد وعزل وتشخيص وعلاج الكائنات الدقيقة المسببة للأمراض للإنسان وتدريب الطلاب لتقديم خدمات طبية للمستشفيات وتحسين النظام الصحي.
الرسالة
يسعى قسم علم الاحياء الدقيقة الي تعليم وتعريف الطلاب بالميكروبات المعدية والتي تشمل البكتريا والفيروسات والفطريات المسببة الأمراض وطرق انتقالها وآليات العدوى ومعرفة طرق تشخيصها وعلاجها والوقاية منها.
الرؤية
هي الوصول الي تعليم حديث في مجال علم الاحياء الدقيقة والبحث العلمي؛ وتخريج أطباء مؤهلين علميا لخدمة وعلاج المواطنين.